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Embora haja ativação dos linfócitos T-CD8+ que exercem controle parcial, essa resposta é insuficiente para eliminar a infecção, que se torna crônica. Inicialmente, o organismo produz anticorpos do tipo IgM, que, devido à exposição contínua aos mesmos antígenos, são gradualmente substituídos por IgG de alta afinidade. Esse aumento de afinidade, decorrente de mutações somáticas e seleção positiva dos linfócitos B, é a base para testes laboratoriais que distinguem infecções recentes das crônicas <ref>[https://www.gov.br/aids/pt-br/central-de-conteudo/publicacoes/2018/manual_tecnico_hiv_27_11_2018_w Manual Técnico para o diagnóstico da infecção pelo HIV em adultos e crianças]</ref>.
'''Com a adesão rigorosa ao tratamento antirretroviral, os indivíduos podem alcançar uma carga viral indetectável e, segundo o Ministério da Saúde e evidências recentes publicadas, essa condição elimina o risco de transmissão do HIV, confirmando o princípio “U=U” (''Undetectable'' = ''Untransmittable'')''' <ref>[https://www.gov.br/saude/pt-br/assuntos/hiv-aids Ministério da Saúde: HIV/AIDS- I=I]</ref><ref>[https://www.thelancet.com/journals/lanhiv Lancet HIV]</ref>.
== Classificação filogenética do HIV ==