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No Brasil, os principais microorganismos causadores das doenças supracitadas são: ''N. meningitidis, S. pneumoniae e H. influenzae, Mycobacterium tuberculosis; Streptococcussp.'' – especialmente os do grupo B; ''S. agalactie; L. monocytogenes; Staphylococcus aureus; Pseudomonas aeruginosa; Klebsiella pneumoniae; Enterobacter sp.; Salmonella sp.; Proteus sp''. Quanto à meningite viral, os principais causadores são: enterovírus, arbovírus, vírus da caxumba, arenavírus (coriomeningite linfocitária), HIV 1, vírus do sarampo, adenovírus, vírus do grupo herpes, varicela-zóster, Epstein-Barr e citomegalovírus. Quanto à meningite fúngica, os microrganismos ''Cryptococcus neoformans e gattii, Candida albicans e tropicalis, Histoplama capsulatum, Paracoccidioides brasiliensis e Aspergillus fumigatus''. Em relação à bem menos frequente a meningite causada por parasitas pode ser citar o ''Toxoplasma gondii, Trypanosoma cruzi, Plasmodium sp, Taenia solium, Cysticercus cellulosae e Angiostrongyllus cantonensis.''
 
== Diagnóstico ==
 
O diagnóstico envolve a análise do líquido cefalorraquidiano (LCR) ou líquor e os achados diferem de acordo com o tipo de meningite, mas podem se sobrepor.
 
Se os pacientes têm sinais sugestivos de aumento da pressão intracraniana ou um efeito de massa, é recomendado a realização de neuroimagens (TC ou RM) antes da punção lombar.
 
A análise do LCR é de vital importância na suspeita de meningite pois as características clínicas por si só não são capazes de distinguir
meningite de outros diagnósticos ou as diferentes etiologias.
 
A cultura do LCR é o teste diagnóstico padrão-ouro para a investigação etiológica bacteriana e fúngica, porém, exames diretos do LCR e a realização de reação em cadeira da polimerase (PCR) para agentes etiológicos suspeitos são frequentemente adicionados. Estes últimos podem dar informações sobre agentes etiológicos específicos, incluindo-se sobre a presença de vírus, que não costumam ser identificados pelos exames de cultura específicos. A sensibilidade da cultura é de 60–90% para LCR coletado antes do início do tratamento com antibióticos, com resultados positivos geralmente disponíveis dentro de 24 a 48 horas. O rendimento da cultura diminui significativamente em pacientes pré-tratados.
 
Além das culturas do LCR, hemoculturas devem ser realizadas.
 
A velocidade de obtenção do diagnóstico da meningite e/ou encefalite, assim como a identificação do agente etiológico são fundamentais para que se estabeleça uma terapia eficaz o mais rápido possível, evitando a morbimortalidade causada por estas doenças
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