Alguns autores questionam a bioética da intervenção ABA neste contexto e os conflitos de interesse (COIs) existentes nos trabalhos científicos do tema. . Um trabalho detectou que 87% dos estudos com declarações afirmando que os autores não tinham COIs, foram de autoria de pesquisadores que tinham COIs de consultoria clínica / de treinamento.
[['''Porém, ao longo de décadas de pesquisas científicas empíricas, acumularam evidências que intervenções baseadas em ABA, quando adequadamente realizadas, logram bons prognósticos em pessoas com TEA, principalmente na primeira infância]].'''
Por bons prognósticos, entenda-se o manejo adequado de comportamentos disruptivos em paralelo com o desenvolvimento de diferentes habilidades essenciais ao sujeito. Por realização adequada, entenda-se terapia precoce, intensiva e realizada por profissionais especializados.