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A Food and Drug Administration – orgão regulador de medicamentos nos Estados Unidos concedeu o registro para este medicamento, entretanto não o indicou para o uso no tratamento das patologias: aspergilose broncopulmonar alérgica, aspergilose invasiva (profilaxia), blastomicose, candida endoftalmite, neutropenia febril (empírico antifúngico terapia), micoses, devido a Scedosporium prolificans, candidíase orofaríngea e aspergilose pulmonar crônica (cavitária ou necrosante) <ref> [http://portalsaude.saude.gov.br/portalsaude/arquivos/pdf/2013/Mar/22/voriconazolVfend.pdf Nota Técnica N° 63 Nota Técnica N° 63/ 2012 - Ministério da Saúde] </ref>.
A [[afotericina B]] (disponível no SUS através do Componente Estratégico de Assistência Farmacêutica) mostrou mesma eficácia que o voriconazol no tratamento de pacientes neutropênicos com aspergilose invasiva, desta forma devendo ser a terapia de primeira escolha. Para pacientes que não responda à [[anfotericina B]], o [[voriconazol]] é indicado. Não houve diferença estatisticamente significativa entre o tratamento inicial com [[voriconazol]] ou após falha terapêutica com a anfotericina <ref> [http://portalsaude.saude.gov.br/portalsaude/arquivos/pdf/2013/Mar/22/voriconazolVfend.pdf Nota Técnica N° 63 Nota Técnica N° 63/ 2012 - Ministério da Saúde] </ref>.
Em neonatos com infecções provocadas por Candida, o antifúngico de primeira escolha é o [[fluconazol]] (disponível no SUS através do Componente Básico de Assistência Farmacêutica). Caso não responda ao fluconazol utiliza-se [[anfotericina B]]. Somente em vigência de insuficiência renal utiliza-se [[anfotericina B lipossomal]]. Não estão recomendados [[caspofungina]] ou [[voriconazol]], devido ao fato de não constar nos estudos pacientes nessa faixa etária <ref> [http://portalsaude.saude.gov.br/portalsaude/arquivos/pdf/2013/Mar/22/voriconazolVfend.pdf Nota Técnica N° 63 Nota Técnica N° 63/ 2012 - Ministério da Saúde] </ref>.